De meest voorkomende bijwerkingen door oestrogenen zijn hoofdpijn, gespannen borsten en misselijkheid. Als je last hebt van die bijwerkingen, kan het de moeite waard zijn om te weten wat de anticonceptiemethoden zijn met alleen progestageen, zoals Cerazette, Depo-Provera, Sayana, Delamonie, Zarelle, Implanon NXT, Mirena of Kyleena. Bij deze methoden kun je je menstruatie niet regelen. Wil je je menstruatie kunnen regelen, dan kun je een anticonceptiemethode kiezen met het meer lichaamseigen estradiolvaleraat (Qlaira), met het lichaamseigen estradiol (Zoely) of met een lage dosering oestrogeen zoals Lovette, Mercilon, Microgynon 20, Yaz, Daylette, Ornibel of NuvaRing. Qlaira en Zoely zijn qua samenstelling anders dan de meeste combinatiepillen. Bij Zoely is één van de hormonen (estradiol) gelijk aan het hormoon dat je zelf van nature produceert in jouw lichaam. Bij Qlaira is één van de hormonen (estradiolvaleraat) na verwerking in je lichaam gelijk aan het hormoon dat je zelf produceert in jouw lichaam.
Als je het hormoon oestrogeen slecht of helemaal niet kunt verdragen, of liever niet gebruikt, kan het zinvol zijn om te switchen naar een methode met een meer lichaamseigen oestrogeen of een methode zonder het hormoon oestrogeen. Ook zijn er methoden zonder hormonen: het koperspiraaltje, sterilisatie of een van de barrièremethoden.